成立日期：1996年8月15日

高雄分會成立於民國85年，為荒野保護協會第二個分會，起初設址於鳳山，自民國90年起遷至現址。高雄分會以「夢想與實踐」為目標，希望能將協會宗旨落實於南臺灣：於96年4月起圈護高雄市大社區（時高雄縣大社鄉）觀音山蓮花池溼地；97年3月起著手進行高雄市那瑪夏區（時高雄縣那瑪夏鄉）悟洞自然教室合力造屋計畫；106年9月起永久會員鄭宇欽無償出借高雄市田寮區祖傳土地供協會認養圈護20年。逐步「取得荒地的監護與管理權，將之圈護，盡可能讓大自然經營自己，恢復生機」，朝實踐協會宗旨邁進。

志工群組：
1.解說組
2.推廣講師組
3.兒童教育組
4.親子團－一團、二團、三團
5.野溪調查小組
6.海灘守護小組
7.氣候變遷小組